Pada tahun 1976, sekelompok orang Indonesia berkumpul untuk mempelajari Alkitab secara rutin di bawah bimbingan Pdt. John Lim. Pada awalnya kelompok ini bertemu di rumah-rumah anggota, namun seiring dengan bertambahnya jumlah peserta, persekutuan ini diadakan di gereja. Gereja-gereja yang pernah dipakai adalah Church of the Open Bible (Rosemead) dan First Baptist of Temple City.

Pada tahun 1980 persekutuan ini memutuskan untuk secara resmi membentuk Gereja Baptis Indonesia Pertama yang merupakan gereja Indonesia yang pertama berdiri di daerah Los Angeles. Pdt. John Lim menjadi gembala sidang pertama gereja ini. Anggota mula-mula tercatat sebanyak 66 orang.

Pada tanggal 10 Juli 1983, GBIP mulai menempati lokasi yang sekarang di 201 E. Lime Ave., Monrovia. Karena anugrah dan kemurahan Tuhan, serta dukungan dan partisipasi dari segenap jemaat, maka GBIP mampu memperoleh dana yang cukup untuk membeli gedung gereja ini.

Setahun kemudian, GBIP diterima menjadi anggota Transformation Ministries (dulunya bernama: American Baptist Churches of the Pacific Southwest).

Setelah melayani sebagai Gembala Sidang selama 22 tahun, pada akhir tahun 1998, Pdt. John Lim memasuki masa pensiun. Hingga sekarang dia tetap aktif berkhotbah, baik di gereja ini maupun di gereja-gereja lainnya.